Ministerstvo zdravotnictví je realizátorem projektu z Operačního programu Zaměstnanost s názvem Projektová kancelář Ministerstva zdravotnictví. Předmětem projektu je vznik a zajištění fungování centrální projektové kanceláře Ministerstva zdravotnictví (MZd) se zaměřením na koordinaci a realizaci projektů MZd v operačních programech ESIF 2014-2020, koordinaci projektů příspěvkových organizací MZd v dotačních programech ESIF a projektů naplňujících strategii Zdraví 2020 - Národní strategie ochrany a podpory zdraví a prevence nemocí (Zdraví 2020).
Výstupem klíčové aktivity č. 2 „Formalizace projektového portfolia MZd a projektového portfolia přímo řízených organizací MZd, tvorba metodik“ bylo vytvoření metodik pro pracovníky MZd a postupů pro přímo řízené organizace Mzd.
Jedná se o tyto dokumenty:
1. Metodika základních principů řízení odboru EF,
2. Metodika posuzování projektových záměrů a správy portfolií,
3. Metodika finančního řízení,
4. Metodika kontroly,
5. Metodika přípravy a realizace projektů MZd,
6. Postup pro přímo řízené organizace MZd pro projekty financované z ESIF,
7. Postup při zajišťování služeb obecného hospodářského zájmu v resortu zdravotnictví prostřednictvím projektů,
8. Metodika pro vyhodnocování dopadů projektů v resortu MZd.
Metodiky jsou k dispozici ke stažení v rámci přílohy č. 1.
K 1. 4. 2018 byla aktualizována metodika „Postup pro přímo řízené organizace Mzd pro projekty ESIF“, která je uvedena v příloze č. 2.
K 1.1.2019 a následně k 1.7.2019 byly aktualizovány dvě metodiky, a to:
- Metodika základních principů řízení odboru EFI a
- Metodika kontroly projektů PO MZd a OSS MZd v rámci ESI fondů v programovém období 2014-2020
Aktualizace se týkala zejména postupů a procesů na základě Příkazu ministra č. 28/2018 Postupy při přípravě a realizaci projektů Ministerstva zdravotnictví, úpravy metody výběru vzorku pro kontroly na místě a veřejnosprávní kontroly, které musí být dle pravidel OPZ vykonány u tzv. dotací v dotaci, postupy při kontrolách na místě atd. Platné verze metodik (tj. verze 1.0 platné od 1.7.2019) jsou ke stažení v rámci přílohy č. 3.
Nad rámec výše uvedených metodik byly k 15. 1. 2019 vytvořeny dvě nové metodiky, a to „Metodický pokyn pro pracovníky Ministerstva zdravotnictví realizující projekty financované z fondů EU a jiných finančních mechanismů pro ošetření rizika střetu zájmů v rámci veřejných zakázek a dotačních řízení“ a „Oběh účetních dokladů v rámci projektů ESIF realizovaných Ministerstvem zdravotnictví“. Tyto metodiky jsou uložené v příloze č. 4.
Další metodikou, která byla vytvořena nad rámec „základních“ metodik, je Metodika administrace dotačních programů realizovaných v rámci projektů Operačního programu Zaměstnanost, která reaguje na fakt, že se ve většině projektů OPZ realizují tzv. dotace v dotaci. Metodika administrace dotačních programů realizovaných v rámci projektů Operačního programu Zaměstnanost vychází z praxe už realizovaných dotačních řízení (např. CDZ I.) je zaměřena na přípravu výzev a administraci dotačních řízení včetně posouzení a hodnocení žádostí o dotaci. Metodika je platná od 1.10.2019 a je uložena v příloze č. 5.
Dále byla ke dni 1. října 2020 vydána Metodika administrace, financování a kontroly dotací v dotaci v rámci projektů realizovaných Ministerstvem zdravotnictví. Jedná se o další metodiku připravenou v rámci projektu Projektová kancelář Ministerstva zdravotnictví, jejímž cílem je standardizace postupů kontroly a administrace tzv. dotací v dotaci v rámci projektů OPZ a nově i EHP. Metodika tvoří přílohu č. 6.