Vláda dne 13. září 2021 schválila návrh Ministerstva pro místní rozvoj (MMR) k využití druhé tranše prostředků REACT-EU ve výši cca 208 mil. EUR (cca 5,4 mld. Kč). Z důvodu vysokého převisu poptávky projektů v oblasti zdravotnictví v první tranši REACT-EU a vzhledem k potřebě připravit zdravotní systém v ČR na případné další vlny COVID-19 a obdobných infekčních onemocnění se MMR rozhodlo využít celou druhou tranši pro projekty v oblasti zdravotnictví. Peníze půjdou k dofinancování 98. výzvy IROP „Rozvoj, modernizace a posílení odolnosti páteřní sítě poskytovatelů zdravotní péče s ohledem na potenciální hrozby“. Prostředky musí být dočerpány do konce roku 2023.
 
Po přidělení druhé tranše alokace REACT-EU členským státům EU bude využití těchto prostředků v ČR probíhat formou revize Integrovaného regionálního operačního programu. Všechny související změny operačního programu musí schválit Monitorovací výbor programu za účasti partnerů a následně revizi programu musí schválit i Evropská komise.